A fosfatase alcalina é uma enzima que está presente em diversos tecidos do corpo (rins, intestino, placenta) mas é produzida principalmente no fígado e nos ossos. Por isso, o exame é útil na investigação de problemas nestes órgãos.
Quando a fosfatase alcalina está alta o médico investigará a saúde dos ductos biliares, a saúde do fígado, dos rins. O nutricionista investigará se há consumo excessivo de gordura. Também pode estar alterada no hipotireoidismo e na presença de infecções intestinais.
Já quando a fosfatase alcalina está baixa deve-se investigar doenças genéticas que afetam os ossos, anemia severa ou diarreia grave (como acontece em pacientes com HIV). Na nutrição a fosfatase alcalina tende a ficar abaixo de 50 U/L quando há deficiência de ferro, magnésio, zinco ou B12.