Bactérias competem por nutrientes e os produtos excretados de uma linhagem podem ser a fonte de energia preferida ou uma fonte de nutrientes essenciais para outra linhagem.
A grande variabilidade nas preferências alimentares entre linhagens bacterianas frequentemente fornece relações complexas de alimentação cruzada entre bactérias, particularmente em ambientes complexos como o intestino humano, o que impacta na digestão e absorção de nutrientes.
Quando uma pessoa tem disbiose não precisa suplementar um monte de bactérias, de todas as cepas possíveis. Em geral, melhorar a dieta é suficiente. Quando não, a suplementação de algumas cepas selecionadas leva ao desenvolvimento de outras, por alimentação cruzada.
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