Cinco principais filos colonizam o trato gastrointestinal humano: firmicutes, bacteroidetes, actinobacteria, proteobacteria e verrucomicrobia. Contudo, os filos firmicutes e bacteroidetes são os mais populosos, representando 90% da microbiota intestinal.
TAXONOMIA DAS BACTÉRIAS INTESTINAIS (Checa-Ros et al., 2021)
Dependendo da proporção em que encontram-se no intestino teremos efeitos mais ou menos positivos. Em geral, os gêneros Bacteroides, Bifidobacterium e Lactobacillus são considerados como tendo efeitos mais benéficos e os Clostridium como tendo efeito mais negativo. Mas uma microbiota saudável terá um equilíbrio de microorganismos.
Importância dos principais filos bacterianos
Firmicutes - representados por mais de 200 gêneros de bactérias, que incluem várias espécies de Lactobacillus, e de Clostridium, alguns com atividade imunomoduladora benéfica, mas outros relacionados à inflamação.
Bacteroidetes - são um dos filos predominantes no intestino humano. Possuem características fermentativas e com capacidade de modular o sistema imune de forma benéfica. Destacam-se neste filo 2 gêneros bacterianos são prevalentes: Bacteroides e Prevotella, associados à manutenção da saúde intestinal e prevenção de doenças. Quando em desequilíbrio na microbiota intestinal, podem ser responsáveis por infecções significativas e podem estar associadas a doenças inflamatórias intestinais, como a Doença de Crohn.
Actinobacteria - representa 2 a 14% das bactérias intestinais. As bifidobactérias possuem funções benéficas para a saúde devido aos seus efeitos, como a produção de vitaminas, a estimulação do sistema imunológico, a inibição de bactérias potencialmente patogênicas, a melhoria na digestão e manutenção da barreira intestinal,
Proteobacteria - representa aproximadamente 5% das bactérias intestinais. Um aumento crônico do filo Proteobacteria é indicativo de uma comunidade microbiana instável. Dentro deste filo encontram-se indivíduos da família Enterobacteriaceae como a Escherichia coli, que em grand equantidade associa-se à Doença Inflamatória Intestinal (DII).
Verrucomicrobia - filo representado principalmente pelo gênero Akkermansia:
O monitoramento do microbioma intestinal pode ser realizado através do sequenciamento de DNA, e informações sobre as bactérias identificadas e sua correlação com as condições clínicas podem fornecer informações valiosas para o profissional da saúde, que poderá ter condutas individualizadas e baseadas em evidências.
