A trissomia do cromossomo 21 aumenta o risco de disfunções na produção hormonal. Uma glândula bastante impactada é a tireóide. Cerca de metade dos pacientes com síndrome de Down têm hipotireoidismo subclínico com TSH elevado e níveis normais de tiroxina. Já o hipertireoidismo é muito menos frequente embora a taxa ainda exceda a incidência de hipertireoidismo na população típica. Pessoas com perda maior de cabelo (alopécea areata) precisam passar por novo rastreamento para disfunção tireoidiana já que estes problemas costumam andar juntos (Castelo-Soccio, Patel & Bauer, 2018).
Anormalidades no desenvolvimento sexual também são comuns. Nas meninas, o hipogonadismo primário se apresenta como atraso na menarca ou adrenarca, enquanto nos meninos pode se manifestar como criptorquidismo, genitália ambígua, micropênis, testículos pequenos, baixa contagem espermática e escasso crescimento dos pelos axilares e púbicos.
O pâncreas também não está livre de alterações por isso a dieta e a atividade física são muito importantes para a prevenção da intolerância à glicose e do diabetes. A secreção de fator de crescimento semelhante à insulina (IGF-1) também é considerado responsável pelo atraso na maturação esquelética e baixa estatura em pacientes com síndrome de Down. (Akhtar, Rizwan, & Bokhari, 2018).
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